RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CAPNS1-202ENST00000586851 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.59□□□□□ -0.87
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCC4O15439 1325 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 MCM5P33992 734 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 MCM2P49736 904 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 RIPK4P57078 832 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP7D2Q96T17 732 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 NFE2L2Q16236 605 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 RICTORQ6R327 1708 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 FYB1O15117 783 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 ST18O60284 1047 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 REC8O95072 547 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF445P59923 1031 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 SIRT1Q96EB6 747 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 ALKQ9UM73 1620 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 AGLP35573 1532 aa9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA0232Q92628 1395 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPRCP08575 1304 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 HMMRO75330 724 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 MBD3O95983 291 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF853P0CG23 659 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 SSH2Q76I76 1423 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGEF10O15013 1369 aa9.52□□□□□ -0.88
CAPNS1-202ENST00000586851 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 ITSN1Q15811 1721 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 DCTPP1Q9H773 170 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 AKAP12Q02952 1782 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 VAMP4O75379 141 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 PHF14O94880 888 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 MCCP23508 829 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 GGT6Q6P531 493 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 LNPKQ9C0E8 428 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 CABP2Q9NPB3 220 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.51□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 TECPR2O15040 1411 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 ANAPC15P60006 121 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 TNNQ9UQP3 1299 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNA1FO60840 1977 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.5□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKAR2BP31323 418 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC22Q5TAA0 569 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF2CQ99661 725 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.49□□□□□ -0.89
CAPNS1-202ENST00000586851 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.49□□□□□ -0.89
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