RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556782.5

PRPF39-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF39, Length 645 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-211ENST00000556782 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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PRPF39-211ENST00000556782 AKNAQ7Z591 1439 aa8.74□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.74□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 KIF14Q15058 1648 aa8.74□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 ALDH1A1P00352 501 aa8.74□□□□□ -1.01
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PRPF39-211ENST00000556782 SKOR1P84550 965 aa8.74□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.74□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 IRF7Q92985 503 aa8.74□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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PRPF39-211ENST00000556782 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.73□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.73□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.73□□□□□ -1.01
PRPF39-211ENST00000556782 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.72□□□□□ -1.01
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PRPF39-211ENST00000556782 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.7□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 USP46P62068 366 aa8.69□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.69□□□□□ -1.02
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PRPF39-211ENST00000556782 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.69□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.69□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.69□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.69□□□□□ -1.02
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PRPF39-211ENST00000556782 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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PRPF39-211ENST00000556782 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.68□□□□□ -1.02
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PRPF39-211ENST00000556782 CEP162Q5TB80 1403 aa8.67□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.67□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.67□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.67□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.67□□□□□ -1.02
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PRPF39-211ENST00000556782 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.66□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.66□□□□□ -1.02
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PRPF39-211ENST00000556782 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 PTPRMP28827 1452 aa8.65□□□□□ -1.02
PRPF39-211ENST00000556782 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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PRPF39-211ENST00000556782 ATP10AO60312 1499 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF39-211ENST00000556782 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.63□□□□□ -1.03
PRPF39-211ENST00000556782 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.62□□□□□ -1.03
PRPF39-211ENST00000556782 ERBB4Q15303 1308 aa8.62□□□□□ -1.03
PRPF39-211ENST00000556782 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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PRPF39-211ENST00000556782 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF39-211ENST00000556782 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF39-211ENST00000556782 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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PRPF39-211ENST00000556782 ZFP42Q96MM3 310 aa8.61□□□□□ -1.03
PRPF39-211ENST00000556782 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.61□□□□□ -1.03
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PRPF39-211ENST00000556782 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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PRPF39-211ENST00000556782 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF39-211ENST00000556782 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.58□□□□□ -1.04
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PRPF39-211ENST00000556782 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 RETREG3Q86VR2 466 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.57□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.57□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.57□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 SCARF1Q14162 830 aa8.57□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 MLECQ14165 292 aa8.57□□□□□ -1.04
PRPF39-211ENST00000556782 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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