RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555009.5

RPS6KL1-209, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS6KL1, Length 2,457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.25■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.25■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 SNX21Q969T3 373 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 ATP7BP35670 1465 aa23.24■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 DDIT3P35638 169 aa23.23■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 PANK2Q9BZ23 570 aa23.23■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.23■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 FCHSD2O94868 740 aa23.23■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.22■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.21■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.21■■□□□ 1.31
RPS6KL1-209ENST00000555009 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF428Q96B54 188 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 LTKP29376 864 aa23.2■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRKAR2BP31323 418 aa23.19■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 TECPR2O15040 1411 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 MRE11P49959 708 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 CPS1P31327 1500 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 NME9Q86XW9 330 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 POLKQ9UBT6 870 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 GCC1Q96CN9 775 aa23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 KIF2CQ99661 725 aa23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.14■■□□□ 1.3
RPS6KL1-209ENST00000555009 VAMP4O75379 141 aa23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 PIK3R4Q99570 1358 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 C3P01024 1663 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 NFE2L2Q16236 605 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 TSPYL6Q8N831 410 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 PTCH1Q13635 1447 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 NUTM2FA1L443 756 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 GBP4Q96PP9 640 aa23.1■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 HMOX1P09601 288 aa23.1■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.09■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 SIRT1Q96EB6 747 aa23.09■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 AKAP12Q02952 1782 aa23.09■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.09■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 CLCN1P35523 988 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 GNAI1P63096 354 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 IFT57Q9NWB7 429 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS6KL1-209ENST00000555009 ITSN1Q15811 1721 aa23.08■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 PTPRUQ92729 1446 aa23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 ABCC4O15439 1325 aa23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 MBIPQ9NS73 344 aa23.06■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.06■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 ZNF853P0CG23 659 aa23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.03■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 PTMSP20962 102 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 COG3Q96JB2 828 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDC45O75419 566 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 IL13P35225 146 aa23.02■■□□□ 1.28
RPS6KL1-209ENST00000555009 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RPS6KL1-209ENST00000555009 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KL1-209ENST00000555009 C8orf58Q8NAV2 365 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KL1-209ENST00000555009 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KL1-209ENST00000555009 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23■■□□□ 1.27
RPS6KL1-209ENST00000555009 CFAP44Q96MT7 982 aa23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms