RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 TMC1Q8TDI8 760 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 HSPA1LP34931 641 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 PSEN1P49768 467 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 CABP1Q9NZU7 370 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 JCADQ9P266 1359 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 ACEP12821 1306 aa7.52□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CS-210ENST00000547912 SBNO1A3KN83 1393 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 ARHGEF10O15013 1369 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 ST18O60284 1047 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 SHPRHQ149N8 1683 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 PXDNQ92626 1479 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 AKAP12Q02952 1782 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 USP6P35125 1406 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 NLRP13Q86W25 1043 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 ABTB2Q8N961 1025 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.212e-10■■■□□ 15.7
CS-210ENST00000547912 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 MYOM1P52179 1685 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 ALS2Q96Q42 1657 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 A0A1W2PP64 1363 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 KIF7Q2M1P5 1343 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 CCDC7Q96M83 1385 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.46□□□□□ -1.21
CS-210ENST00000547912 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 NLRP6P59044 892 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 SSH2Q76I76 1423 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 COG3Q96JB2 828 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 PANK3Q9H999 370 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 PIK3C2AO00443 1686 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 G3V3G9 751 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 ADAMTS2O95450 1211 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 USP19O94966 1318 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 ABCA3Q99758 1704 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 NSD2O96028 1365 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 USP31Q70CQ4 1352 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 USP54Q70EL1 1684 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 GCP02774 474 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 NME9Q86XW9 330 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 NGLY1Q96IV0 654 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 C8orf37Q96NL8 207 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 FYB1O15117 783 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 SLIT3O75094 1523 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 LRP6O75581 1613 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-210ENST00000547912 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.41□□□□□ -1.22
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