RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-208ENST00000546997 SLIT3O75094 1523 aa21.62■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.62■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.61■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.61■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 PLEKHG5O94827 1062 aa21.61■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 USP19O94966 1318 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.59■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 CERKQ8TCT0 537 aa21.58■■□□□ 1.05
BRF1-208ENST00000546997 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.56■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 FLT4P35916 1363 aa21.55■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 TOM1O60784 492 aa21.55■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.55■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 ARHGEF10O15013 1369 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 GCP02774 474 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.54■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 IL13P35225 146 aa21.53■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 ABCA3Q99758 1704 aa21.53■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.52■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.52■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 AMPHP49418 695 aa21.52■■□□□ 1.04
BRF1-208ENST00000546997 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.51■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 PDE3BQ13370 1112 aa21.51■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 HOXC9P31274 260 aa21.5■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 RGPD5Q99666 1765 aa21.5■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.5■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 PHLPP1O60346 1717 aa21.5■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 PIP4K2BP78356 416 aa21.49■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 RTL1A6NKG5 1358 aa21.49■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 USP35Q9P2H5 1018 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 PLCB2Q00722 1185 aa21.47■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.46■■□□□ 1.03
BRF1-208ENST00000546997 APAF1O14727 1248 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 HMOX1P09601 288 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 IP6K1Q92551 441 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 COL18A1P39060 1754 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 NBR1Q14596 966 aa21.44■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 RUNDC1Q96C34 613 aa21.44■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.44■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.43■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.42■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.41■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.41■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 KIAA0232Q92628 1395 aa21.41■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 FCHSD2O94868 740 aa21.41■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 PRKAR2BP31323 418 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 CPDO75976 1380 aa21.39■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
BRF1-208ENST00000546997 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.39■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 EYA1Q99502 592 aa21.39■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.38■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 CHRNA2Q15822 529 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 ABCC6O95255 1503 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 KDRP35968 1356 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 NEUROD2Q15784 382 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.36■■□□□ 1.01
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BRF1-208ENST00000546997 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 ZNF521Q96K83 1311 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.34■■□□□ 1.01
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BRF1-208ENST00000546997 ERBB3P21860 1342 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 MS4A1P11836 297 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 NBPF4Q96M43 638 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.33■■□□□ 1.01
BRF1-208ENST00000546997 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
BRF1-208ENST00000546997 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
BRF1-208ENST00000546997 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
BRF1-208ENST00000546997 WWC1Q8IX03 1113 aa21.3■■□□□ 1
BRF1-208ENST00000546997 NGEFQ8N5V2 710 aa21.29■■□□□ 1
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