RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 RAB3GAP1Q15042 981 aa11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 VAMP4O75379 141 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 IFT57Q9NWB7 429 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 CLCN1P35523 988 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 POLKQ9UBT6 870 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP7BP35670 1465 aa11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 KIF2CQ99661 725 aa11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 ABCC4O15439 1325 aa11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 ALKQ9UM73 1620 aa11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 HMOX1P09601 288 aa11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 CDC45O75419 566 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 CFAP44Q96MT7 982 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 MBIPQ9NS73 344 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.71□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 TSPYL6Q8N831 410 aa11.71□□□□□ -0.53
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF853P0CG23 659 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 RICTORQ6R327 1708 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 DLC1Q96QB1 1528 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 FBLN1P23142 703 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 IL13P35225 146 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 ESPNB1AK53 854 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 RABEP1Q15276 862 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 SSFA2P28290 1259 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 DCTPP1Q9H773 170 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 TTC22Q5TAA0 569 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 NME9Q86XW9 330 aa11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 CASC1Q6TDU7 716 aa11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 COG3Q96JB2 828 aa11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1-202ENST00000546471 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 NUCB2P80303 420 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 OSCARQ8IYS5 282 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 ERBB4Q15303 1308 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM83GA6ND36 823 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 USP26Q9BXU7 913 aa11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP10DQ9P241 1426 aa11.62□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 DCTN1Q14203 1278 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 ST18O60284 1047 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 MCTP1Q6DN14 999 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 CEP85Q6P2H3 762 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3P1-202ENST00000546471 PPP1R9BQ96SB3 815 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms