RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 ACDQ96AP0 544 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 OVOL3O00110 214 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 BMP2P12643 396 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 AMHR2Q16671 573 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SULF1Q8IWU6 871 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 PHOX2BQ99453 314 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC10A3P09131 477 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 KMT5BQ4FZB7 885 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 RSPH4AQ5TD94 716 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCDC102AQ96A19 550 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 MBIPQ9NS73 344 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 DBX1A6NMT0 343 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 CD46P15529 392 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 CLCN1P35523 988 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 GCGRP47871 477 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SKOR1P84550 965 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM161AQ3B820 660 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 AK7Q96M32 723 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPCPD1Q9NPB8 672 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 LRRC4BQ9NT99 713 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 PIK3R2O00459 728 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 GNB5O14775 395 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 OIP5O43482 229 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 CFHP08603 1231 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 TIMP2P16035 220 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 WDR4P57081 412 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 USP46P62068 366 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCUBE3Q8IX30 993 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRDM9Q9NQV7 894 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRIM66O15016 1216 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 UPP2O95045 317 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 ADH1CP00326 375 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 GJA5P36382 358 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATP6V1AP38606 617 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 GP2P55259 537 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 DIXDC1Q155Q3 683 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 TUSC1Q2TAM9 212 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 GRIPAP1Q4V328 841 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 MORN1Q5T089 497 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 DBX2Q6ZNG2 339 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 RNF112Q9ULX5 631 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 DDX11L8A8MPP1 907 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SHISA8B8ZZ34 492 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 KDM4AO75164 1064 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDE4DQ08499 809 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 NNTQ13423 1086 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF124Q15973 351 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 RDH13Q8NBN7 331 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 THAP11Q96EK4 314 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC35F4A4IF30 521 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SIAH2O43255 324 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 HOXA2O43364 376 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 WNT7BP56706 349 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 FUT2Q10981 343 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 Q3C1V9 767 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 MSS51Q4VC12 460 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 BRICD5Q6PL45 260 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 LINC00114Q6XXX2 140 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 PARP9Q8IXQ6 854 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 LINC00528Q8N1L1 170 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 EHBP1Q8NDI1 1231 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC24A3Q9HC58 644 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPDYE5A6NIY4 337 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 H2AFB1P0C5Y9 115 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 H2AFB2P0C5Z0 115 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SSTR4P31391 388 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 MMP16P51512 607 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 DESI1Q6ICB0 168 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPIRE2Q8WWL2 714 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 NLRP7Q8WX94 980 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRIM52Q96A61 297 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 GOPCQ9HD26 462 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 FIGNL2A6NMB9 653 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPTLC1O15269 473 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 DXOO77932 396 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 MS4A1P11836 297 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 AMPD1P23109 780 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUTM1Q86Y26 1132 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms