RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-208ENST00000506437 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.99□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 GCP02774 474 aa14.98□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.98□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.98□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.97□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.97□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.97□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 DCCP43146 1447 aa14.97□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 NSD2O96028 1365 aa14.96□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.96□□□□□ -0.01
ITGA3-208ENST00000506437 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 CERKQ8TCT0 537 aa14.96□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 CFAP53Q96M91 514 aa14.96□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.95□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 APAF1O14727 1248 aa14.95□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 TOM1O60784 492 aa14.95□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.94□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 ADAMTS2O95450 1211 aa14.94□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 PDE4CQ08493 712 aa14.94□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.94□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.93□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 PXDNQ92626 1479 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 AAMPQ13685 434 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 USP35Q9P2H5 1018 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 HOXC9P31274 260 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 FGD1P98174 961 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 PEAK1Q9H792 1746 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 IL13P35225 146 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-208ENST00000506437 PRKAR2BP31323 418 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 KIAA0232Q92628 1395 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 STRN4Q9NRL3 753 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 USP31Q70CQ4 1352 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 EP400Q96L91 3159 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 EYA1Q99502 592 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 NUDCQ9Y266 331 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 KIF1AQ12756 1690 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 NBPF4Q96M43 638 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 HSPA1LP34931 641 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 SHPRHQ149N8 1683 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 GSE1Q14687 1217 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 LTN1O94822 1766 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 DCTN1Q14203 1278 aa14.85□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 FLT4P35916 1363 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 FAM83GA6ND36 823 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 RGPD5Q99666 1765 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 ALS2Q96Q42 1657 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 SBNO1A3KN83 1393 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 IP6K1Q92551 441 aa14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 USP19O94966 1318 aa14.83□□□□□ -0.03
ITGA3-208ENST00000506437 NFAT5O94916 1531 aa14.82□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.81□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 RUNDC1Q96C34 613 aa14.81□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 BTG4Q9NY30 223 aa14.81□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 ARHGEF10O15013 1369 aa14.81□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.81□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.81□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 PHLPP1O60346 1717 aa14.8□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 RIPK4P57078 832 aa14.8□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 C8orf37Q96NL8 207 aa14.79□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.79□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 EVA1CP58658 441 aa14.78□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.78□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.78□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 INSRP06213 1382 aa14.78□□□□□ -0.04
ITGA3-208ENST00000506437 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms