RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494150.1

APOBEC3G-207, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 2

Gene APOBEC3G, Length 2,775 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-207ENST00000494150 SIRT1Q96EB6 747 aa14.74□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.74□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 TECPR2O15040 1411 aa14.74□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 SOX12O15370 315 aa14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 FCHSD2O94868 740 aa14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.73□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 PTPRUQ92729 1446 aa14.72□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 ACEP12821 1306 aa14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.71□□□□□ -0.05
APOBEC3G-207ENST00000494150 IL13P35225 146 aa14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.71□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 C3P01024 1663 aa14.7□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.69□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 NFE2L2Q16236 605 aa14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 CLCN1P35523 988 aa14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 FAM83GA6ND36 823 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 TRIM27P14373 513 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 IL16Q14005 1332 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 ITSN1Q15811 1721 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 KLHL34Q8N239 644 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 TBX22Q9Y458 520 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.65□□□□□ -0.06
APOBEC3G-207ENST00000494150 AKAP12Q02952 1782 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 DCTN1Q14203 1278 aa14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 BECN1Q14457 450 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 KCNA6P17658 529 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 TSPYL6Q8N831 410 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 PANK2Q9BZ23 570 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.62□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 USP6P35125 1406 aa14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 SLIT1O75093 1534 aa14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.61□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 MBIPQ9NS73 344 aa14.6□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.58□□□□□ -0.07
APOBEC3G-207ENST00000494150 VAMP4O75379 141 aa14.58□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 GNAI1P63096 354 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.57□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 SEC24BO95487 1268 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 IFT57Q9NWB7 429 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 MCM10Q7L590 875 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.56□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 USP19O94966 1318 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 ZNF853P0CG23 659 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 DIP2AQ14689 1571 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 KIF16BQ96L93 1317 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 PTCH1Q13635 1447 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 NLRP6P59044 892 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 CFAP44Q96MT7 982 aa14.55□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 KRT24Q2M2I5 525 aa14.54□□□□□ -0.08
APOBEC3G-207ENST00000494150 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms