RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC11Q96J66 1382 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3C2BO00750 1634 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-204ENST00000483092 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 DCTN1Q14203 1278 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 POLKQ9UBT6 870 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 OFD1O75665 1012 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 SHPRHQ149N8 1683 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC27Q2M243 656 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 FAM83GA6ND36 823 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 NSD2O96028 1365 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 PLCB2Q00722 1185 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRMP28827 1452 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 TSPYL6Q8N831 410 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 TSC1Q92574 1164 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 WASLO00401 505 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 COG3Q96JB2 828 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 METP08581 1390 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 MAP7D2Q96T17 732 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 FAM177BA6PVY3 158 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 RICTORQ6R327 1708 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 APBB1O00213 710 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 CBX1P83916 185 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 FCHSD2O94868 740 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 RAB3GAP1Q15042 981 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 ALKQ9UM73 1620 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-204ENST00000483092 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 BAG4O95429 457 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 PTMSP20962 102 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 CHAMP1Q96JM3 812 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM4Q9UKN5 801 aa19.94■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 KRT24Q2M2I5 525 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP1Q9C000 1473 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 RBSNQ9H1K0 784 aa19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 ZFYVE9O95405 1425 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 IGSF3O75054 1194 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 NFE2L2Q16236 605 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 SYCE3A1L190 88 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 SMC5Q8IY18 1101 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 NUTM2GQ5VZR2 741 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 MBIPQ9NS73 344 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 MIS18AQ9NYP9 233 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYM3Q14202 1370 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL40Q2TBA0 621 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R9BQ96SB3 815 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 A2ML1A8K2U0 1454 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 MCM10Q7L590 875 aa19.89■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 KIF16BQ96L93 1317 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 IL13P35225 146 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.88■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 AAMPQ13685 434 aa19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 C14orf37Q86TY3 774 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYE4A6NLX3 237 aa19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms