RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-208ENST00000482785 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 EID1Q9Y6B2 187 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 SLIT2O94813 1529 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 SAMD9Q5K651 1589 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 GRIN3BO60391 1043 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 MYOM2P54296 1465 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 POTEJP0CG39 1038 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 VPS72Q15906 364 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 OTUD5Q96G74 571 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 FLIIQ13045 1269 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 COL6A3P12111 3177 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 LBX1P52954 281 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 MST1RQ04912 1400 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 ARID3AQ99856 593 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 FAM117AQ9C073 453 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 SZT2Q5T011 3432 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 SEC24BO95487 1268 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 PDIA6Q15084 440 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 MICALL2Q8IY33 904 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 MTFR1LQ9H019 292 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 OCEL1Q9H607 264 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 USP32Q8NFA0 1604 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-208ENST00000482785 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 GOPCQ9HD26 462 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.26□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 ABCC5O15440 1437 aa6.26□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 APBB1O00213 710 aa6.26□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 GPR37O15354 613 aa6.26□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 FSTL1Q12841 308 aa6.26□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 SNX27Q96L92 541 aa6.26□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 DPYSL4O14531 572 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 PLCG2P16885 1265 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 MAP2K5Q13163 448 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 AMHR2Q16671 573 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 GCC1Q96CN9 775 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 LAMC1P11047 1609 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 CACNA1GO43497 2377 aa6.24□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.24□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.24□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.23□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 DSG2Q14126 1118 aa6.23□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.23□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 ERVK-7P63135 1459 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 A6NJR5 290 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 G3V3G9 751 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 IRF6O14896 467 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 TMC2Q8TDI7 906 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC102AQ96A19 550 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-208ENST00000482785 MEGF6O75095 1541 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-208ENST00000482785 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-208ENST00000482785 AIDAQ96BJ3 306 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-208ENST00000482785 DCCP43146 1447 aa6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-208ENST00000482785 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SHQ1-208ENST00000482785 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1-208ENST00000482785 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.2□□□□□ -1.42
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