RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478911.1

SUPT20H-215, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 591 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-215ENST00000478911 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 ARID3CA6NKF2 412 aa6.56□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 GSK3AP49840 483 aa6.56□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 PTPRNQ16849 979 aa6.56□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 MPNDQ8N594 471 aa6.56□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.56□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.56□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 MAN1A2O60476 641 aa6.55□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF511Q8NB15 262 aa6.55□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.55□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.55□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.55□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 DESI1Q6ICB0 168 aa6.54□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.54□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.54□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.54□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 GPR37L1O60883 481 aa6.53□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 ABL2P42684 1182 aa6.53□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 KCNH2Q12809 1159 aa6.53□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SUPT20H-215ENST00000478911 PPFIA3O75145 1194 aa6.52□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 GDF11O95390 407 aa6.52□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 RASSF7Q02833 373 aa6.52□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.52□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 LYPD8Q6UX82 237 aa6.52□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.52□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ARXQ96QS3 562 aa6.52□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 IRF5Q13568 498 aa6.51□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.51□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.51□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 WWC1Q8IX03 1113 aa6.5□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 BMP2P12643 396 aa6.49□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ARID5BQ14865 1188 aa6.49□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 NR6A1Q15406 480 aa6.49□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ITPKCQ96DU7 683 aa6.49□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 UPP2O95045 317 aa6.48□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.48□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 CDK15Q96Q40 435 aa6.48□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ARID3AQ99856 593 aa6.48□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.48□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 POM121CA8CG34 1229 aa6.47□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 CTHP32929 405 aa6.47□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 KRT76Q01546 638 aa6.47□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.47□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.47□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.47□□□□□ -1.37
SUPT20H-215ENST00000478911 NR3C2P08235 984 aa6.46□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 NR5A1Q13285 461 aa6.46□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 HOMEZQ8IX15 550 aa6.46□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 MEIOBQ8N635 442 aa6.46□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 FOXJ1Q92949 421 aa6.46□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 MAP10Q9P2G4 905 aa6.46□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.46□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 WASHC4Q2M389 1173 aa6.45□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 VAC14Q08AM6 782 aa6.44□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 GLMNQ92990 594 aa6.44□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.44□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 AGERQ15109 404 aa6.43□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.43□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 SVOPQ8N4V2 548 aa6.43□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 PNMA1Q8ND90 353 aa6.43□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.43□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.43□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 GRM5P41594 1212 aa6.42□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 IRS1P35568 1242 aa6.41□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 IGHA1P01876 353 aa6.4□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 PTSQ03393 145 aa6.4□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.4□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.4□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 ALG2Q9H553 416 aa6.4□□□□□ -1.38
SUPT20H-215ENST00000478911 TTLL8A6PVC2 850 aa6.39□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 ZBBXA8MT70 800 aa6.39□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 FBXO45P0C2W1 286 aa6.39□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 FSHRP23945 695 aa6.39□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 SOX11P35716 441 aa6.39□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 NR1H3Q13133 447 aa6.39□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.39□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.38□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.38□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 WHAMMQ8TF30 809 aa6.38□□□□□ -1.39
SUPT20H-215ENST00000478911 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms