RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 VAMP4O75379 141 aa23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 SIRT1Q96EB6 747 aa23.1■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.09■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.09■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.09■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.09■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 MBIPQ9NS73 344 aa23.08■■□□□ 1.29
SYNE4-204ENST00000465425 NUCB1Q02818 461 aa23.08■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 TECPR2O15040 1411 aa23.07■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 TSPYL6Q8N831 410 aa23.07■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF853P0CG23 659 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 CFAP44Q96MT7 982 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 CPS1P31327 1500 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 LNPKQ9C0E8 428 aa23.05■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.05■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.05■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 PTCH1Q13635 1447 aa23.05■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 TNRQ92752 1358 aa23.04■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.04■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.03■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 GCC1Q96CN9 775 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 PIK3R4Q99570 1358 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE4-204ENST00000465425 FAM83GA6ND36 823 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 IL27Q8NEV9 243 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 ITSN1Q15811 1721 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 PRR36Q9H6K5 1346 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 ABCC4O15439 1325 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 C3P01024 1663 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 AKAP12Q02952 1782 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 DCTN1Q14203 1278 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.95■■□□□ 1.27
SYNE4-204ENST00000465425 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 HSCBQ8IWL3 235 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 ACEP12821 1306 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 NUTM2FA1L443 756 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.91■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.91■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.9■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.9■■□□□ 1.26
SYNE4-204ENST00000465425 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 USP6P35125 1406 aa22.88■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 LTKP29376 864 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 MCM10Q7L590 875 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 SOX12O15370 315 aa22.86■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 CHL1O00533 1208 aa22.85■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.85■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 EID1Q9Y6B2 187 aa22.85■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.84■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 KRT24Q2M2I5 525 aa22.83■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 SNX21Q969T3 373 aa22.83■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 MCM4P33991 863 aa22.83■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.83■■□□□ 1.25
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0232Q92628 1395 aa22.83■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 USP31Q70CQ4 1352 aa22.82■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 PTPRCP08575 1304 aa22.81■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 DCTPP1Q9H773 170 aa22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 CDC45O75419 566 aa22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.79■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 PTPRUQ92729 1446 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF10O15013 1369 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 PEAK1Q9H792 1746 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.78■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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