RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460778.1

RPL23AP56-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 56, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP56, Length 453 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP56-201ENST00000460778 SLIT3O75094 1523 aa6.72□□□□□ -1.33
RPL23AP56-201ENST00000460778 NFAT5O94916 1531 aa6.72□□□□□ -1.33
RPL23AP56-201ENST00000460778 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RPL23AP56-201ENST00000460778 COG3Q96JB2 828 aa6.72□□□□□ -1.33
RPL23AP56-201ENST00000460778 POLKQ9UBT6 870 aa6.72□□□□□ -1.33
RPL23AP56-201ENST00000460778 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.71□□□□□ -1.33
RPL23AP56-201ENST00000460778 KIAA0232Q92628 1395 aa6.71□□□□□ -1.33
RPL23AP56-201ENST00000460778 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.71□□□□□ -1.33
RPL23AP56-201ENST00000460778 PEAK1Q9H792 1746 aa6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 MORC1Q86VD1 984 aa6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 NGLY1Q96IV0 654 aa6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 POLA2Q14181 598 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 IP6K1Q92551 441 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 CPDO75976 1380 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 PPP2R1AP30153 589 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 MTHFSP49914 203 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 C8orf37Q96NL8 207 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 BTG4Q9NY30 223 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 AFF2P51816 1311 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 NRAPQ86VF7 1730 aa6.68□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 SLIT2O94813 1529 aa6.68□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 HOXC9P31274 260 aa6.68□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 POTEAQ6S8J7 498 aa6.68□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 NSD2O96028 1365 aa6.68□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 CCDC184Q52MB2 194 aa6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 USP21Q9UK80 565 aa6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 AMPHP49418 695 aa6.66□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 EVA1CP58658 441 aa6.66□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 FKBP8Q14318 412 aa6.66□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.66□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 NBPF4Q96M43 638 aa6.66□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 IL13P35225 146 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 RALBP1Q15311 655 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 VPS72Q15906 364 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 STRN4Q9NRL3 753 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP56-201ENST00000460778 INSRP06213 1382 aa6.65□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 EYA1Q99502 592 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 FLT4P35916 1363 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 ATRNO75882 1429 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 GLI3P10071 1580 aa6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 ERBB3P21860 1342 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 MIER1Q8N108 512 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 USP35Q9P2H5 1018 aa6.63□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 ABCC6O95255 1503 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 EP400Q96L91 3159 aa6.61□□□□□ -1.35
RPL23AP56-201ENST00000460778 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms