RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452236.2

ZBED9-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED9, Length 4,877 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9-201ENST00000452236 MCM10Q7L590 875 aa15.22■□□□□ 0.03
ZBED9-201ENST00000452236 RILPL2Q969X0 211 aa15.22■□□□□ 0.03
ZBED9-201ENST00000452236 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
ZBED9-201ENST00000452236 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.21■□□□□ 0.03
ZBED9-201ENST00000452236 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
ZBED9-201ENST00000452236 PTPRKQ15262 1439 aa15.21■□□□□ 0.03
ZBED9-201ENST00000452236 FYB1O15117 783 aa15.21■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.21■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 WWC1Q8IX03 1113 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 MIS18AQ9NYP9 233 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 COG6Q9Y2V7 657 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 MARCH6O60337 910 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.2■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.19■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.19■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.19■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 FBLN1P23142 703 aa15.18■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 ST5P78524 1137 aa15.18■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 NPATQ14207 1427 aa15.18■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.18■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 NBPF4Q96M43 638 aa15.18■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.18■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 DCTN1Q14203 1278 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 WASHC4Q2M389 1173 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 SAMD9Q5K651 1589 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 NLRP1Q9C000 1473 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 GPTP24298 496 aa15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 C6orf229H3BNL8 230 aa15.16■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 SETDB2Q96T68 719 aa15.16■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.16■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 TRDNQ13061 729 aa15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 IP6K1Q92551 441 aa15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
ZBED9-201ENST00000452236 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 ERC2O15083 957 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 NSD2O96028 1365 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.13■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.13■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.12■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 GNPATO15228 680 aa15.12■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 FLT4P35916 1363 aa15.12■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.12■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.12■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.11■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 GPR162Q16538 588 aa15.11■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 ABCC11Q96J66 1382 aa15.11■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 SIRT1Q96EB6 747 aa15.11■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.11■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.1■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 SIL1Q9H173 461 aa15.1■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.1■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 DCAF5Q96JK2 942 aa15.1■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 GNAI2P04899 355 aa15.1■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.1■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 MYD88Q99836 296 aa15.09■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
ZBED9-201ENST00000452236 SLC39A6Q13433 755 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms