RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 UBXN4Q92575 508 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ERLIN1O75477 346 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SLMAPQ14BN4 828 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 DYTNA2CJ06 578 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CAND2O75155 1236 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT6Q14141 434 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF428Q96B54 188 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM4Q9C037 500 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TSPY26PQ9H489 355 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 NEDD9Q14511 834 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN26Q16670 478 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC114Q96M63 670 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CAPN2P17655 700 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MCTP1Q6DN14 999 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 PDILTQ8N807 584 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 RANBP1P43487 201 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 RWDD2BP57060 319 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC102AQ96A19 550 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF280DQ6N043 979 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MED4Q9NPJ6 270 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MBD3O95983 291 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MTMR7Q9Y216 660 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 FBLN2P98095 1184 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ARID3CA6NKF2 412 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 LCA5Q86VQ0 697 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SETDB1Q15047 1291 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ERLIN2O94905 339 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB17Q13105 803 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SYCP1Q15431 976 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MYO1CO00159 1063 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 NUCB1Q02818 461 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ARL10Q8N8L6 244 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ITFG2Q969R8 447 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CDKL5O76039 1030 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 RRP1P56182 461 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 RIPK4P57078 832 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PEX14O75381 377 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 EBAG9O00559 213 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 POTEDQ86YR6 584 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ATG3Q9NT62 314 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 USP25Q9UHP3 1055 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 BECN2A8MW95 431 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 DESP17661 470 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 KIF5BP33176 963 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SAAL1Q96ER3 474 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 GBP3Q9H0R5 595 aa6.57□□□□□ -1.36
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