RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429159.6

MEG3-208, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,608 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-208ENST00000429159 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.35■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.34■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 HMOX1P09601 288 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 RIPK4P57078 832 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 PEAK1Q9H792 1746 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-208ENST00000429159 ARHGEF10O15013 1369 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
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MEG3-208ENST00000429159 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 NFE2L2Q16236 605 aa24.31■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.31■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 IL16Q14005 1332 aa24.3■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 HOXC9P31274 260 aa24.29■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
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MEG3-208ENST00000429159 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.28■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 SLIT3O75094 1523 aa24.27■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 NFAT5O94916 1531 aa24.27■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 IP6K1Q92551 441 aa24.27■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 USP19O94966 1318 aa24.27■■□□□ 1.48
MEG3-208ENST00000429159 SLAIN2Q9P270 581 aa24.26■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.25■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 GCP02774 474 aa24.25■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 LTN1O94822 1766 aa24.25■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.24■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 ALS2Q96Q42 1657 aa24.23■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.23■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.23■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.22■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.22■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 BRINP3Q76B58 766 aa24.21■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 KDRP35968 1356 aa24.21■■□□□ 1.47
MEG3-208ENST00000429159 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.19■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 EYA1Q99502 592 aa24.19■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 PXDNQ92626 1479 aa24.18■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.18■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.17■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.17■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.16■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 GNAI1P63096 354 aa24.15■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
MEG3-208ENST00000429159 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.14■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 IFT57Q9NWB7 429 aa24.13■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.11■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 ABCC6O95255 1503 aa24.1■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 ZNF428Q96B54 188 aa24.1■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 PLEKHG5O94827 1062 aa24.08■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 CFAP44Q96MT7 982 aa24.08■■□□□ 1.45
MEG3-208ENST00000429159 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.06■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 CPDO75976 1380 aa24.05■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 PLIN1O60240 522 aa24.04■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.04■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 ZNF853P0CG23 659 aa24.03■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.03■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 NBPF4Q96M43 638 aa24.03■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 MS4A1P11836 297 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 PDE3AQ14432 1141 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 BCAR3O75815 825 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 CERKQ8TCT0 537 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 FBXO41Q8TF61 875 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-208ENST00000429159 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.01■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 ERBB3P21860 1342 aa24■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 NCAPD2Q15021 1401 aa24■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 FAM83GA6ND36 823 aa23.99■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.99■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 MAP3K5Q99683 1374 aa23.99■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.99■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 MBIPQ9NS73 344 aa23.99■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
MEG3-208ENST00000429159 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.98■■□□□ 1.43
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