RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 IL16Q14005 1332 aa30■■■□□ 2.39
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FAAP20-209ENST00000428120 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.98■■■□□ 2.39
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FAAP20-209ENST00000428120 DCTN1Q14203 1278 aa29.88■■■□□ 2.37
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FAAP20-209ENST00000428120 PSME1Q06323 249 aa29.87■■■□□ 2.37
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FAAP20-209ENST00000428120 IFT57Q9NWB7 429 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-209ENST00000428120 GNAI1P63096 354 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-209ENST00000428120 MBIPQ9NS73 344 aa29.82■■■□□ 2.36
FAAP20-209ENST00000428120 FOXO3O43524 673 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA2P54652 639 aa29.8■■■□□ 2.36
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGEF10O15013 1369 aa29.8■■■□□ 2.36
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FAAP20-209ENST00000428120 EYA1Q99502 592 aa29.8■■■□□ 2.36
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNF853P0CG23 659 aa29.79■■■□□ 2.36
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FAAP20-209ENST00000428120 TSPYL6Q8N831 410 aa29.78■■■□□ 2.36
FAAP20-209ENST00000428120 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
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FAAP20-209ENST00000428120 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.72■■■□□ 2.35
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FAAP20-209ENST00000428120 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
FAAP20-209ENST00000428120 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.72■■■□□ 2.35
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FAAP20-209ENST00000428120 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.71■■■□□ 2.35
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FAAP20-209ENST00000428120 KIF16BQ96L93 1317 aa29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 LTN1O94822 1766 aa29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM94Q12767 1356 aa29.69■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 MS4A1P11836 297 aa29.67■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.67■■■□□ 2.34
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FAAP20-209ENST00000428120 KRT24Q2M2I5 525 aa29.64■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.64■■■□□ 2.34
FAAP20-209ENST00000428120 RTL1A6NKG5 1358 aa29.64■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 ATF3P18847 181 aa29.63■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.63■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 IP6K1Q92551 441 aa29.63■■■□□ 2.33
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FAAP20-209ENST00000428120 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.62■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 CHL1O00533 1208 aa29.62■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.61■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 GCP02774 474 aa29.6■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.6■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 CRB1P82279 1406 aa29.6■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
FAAP20-209ENST00000428120 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.59■■■□□ 2.33
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