RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FBLN1P23142 703 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NLRP6P59044 892 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FKBP8Q14318 412 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EVX2Q03828 476 aa13.03□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.02□□□□□ -0.32
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGEF10O15013 1369 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNS3Q68CZ2 1445 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PXDNQ92626 1479 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APAF1O14727 1248 aa13.01□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.01□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLKQ9UBT6 870 aa13.01□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ALS2Q96Q42 1657 aa13.01□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEFLP07196 543 aa13□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE3BQ13370 1112 aa13□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.99□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.99□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF521Q96K83 1311 aa12.99□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.98□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBAP1LF5GYI3 381 aa12.97□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CERKQ8TCT0 537 aa12.97□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RUNDC1Q96C34 613 aa12.97□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.97□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLIT3O75094 1523 aa12.97□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP19O94966 1318 aa12.96□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SSUH2Q9Y2M2 353 aa12.96□□□□□ -0.33
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RTL1A6NKG5 1358 aa12.95□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FLT4P35916 1363 aa12.95□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SOX12O15370 315 aa12.95□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AMPHP49418 695 aa12.95□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.94□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C19orf67A6NJJ6 358 aa12.94□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TCP11L2Q8N4U5 519 aa12.94□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NFAT5O94916 1531 aa12.94□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LTN1O94822 1766 aa12.94□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHLPP1O60346 1717 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GCP02774 474 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGA2Q08379 1002 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PEAK1Q9H792 1746 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PIP4K2BP78356 416 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLFN5Q08AF3 891 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLEKHF1Q96S99 279 aa12.93□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL13P35225 146 aa12.92□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NGEFQ8N5V2 710 aa12.92□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEFMP07197 916 aa12.91□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEUROD2Q15784 382 aa12.91□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WWC1Q8IX03 1113 aa12.91□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.91□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCC6O95255 1503 aa12.9□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.9□□□□□ -0.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IP6K1Q92551 441 aa12.89□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.89□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HOXC9P31274 260 aa12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCA3Q99758 1704 aa12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CPDO75976 1380 aa12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLEKHG5O94827 1062 aa12.88□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 E9PSI1 815 aa12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FCHSD2O94868 740 aa12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HMOX1P09601 288 aa12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRKAR2BP31323 418 aa12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RRP1P56182 461 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC27Q2M243 656 aa12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.87□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.86□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms