RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411331.1

RNU6-387P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 387, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-387P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZNF787Q6DD87 383 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 ESPNB1AK53 854 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 J3QL48 77 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 NR3C2P08235 984 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 SEMA3FQ13275 785 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 WWC1Q8IX03 1113 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 CDK15Q96Q40 435 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-387P-201ENST00000411331 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 SOX11P35716 441 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 ARID5BQ14865 1188 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 FSHRP23945 695 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 RAB15P59190 212 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 ADH1CP00326 375 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 ALDH1A1P00352 501 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 SMPD1P17405 629 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 RFX1P22670 979 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 SCTRP47872 440 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 RNF135Q8IUD6 432 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 MPNDQ8N594 471 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 USP17L5A8MUK1 530 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 ATP9BO43861 1147 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 SKIP12755 728 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 CDCA8Q53HL2 280 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 USP17L3A6NCW0 530 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 USP17L4A6NCW7 530 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 PRR20EP86478 221 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 PRR20CP86479 221 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 PRR20DP86480 221 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 PRR20BP86481 221 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 PRR20AP86496 221 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-387P-201ENST00000411331 GFRA3O60609 400 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 LILRA1O75019 489 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 NNTQ13423 1086 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 NCOA4Q13772 614 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 HPS1Q92902 700 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 ITPKCQ96DU7 683 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 CYLDQ9NQC7 956 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 CARNS1A5YM72 827 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 CLDN10P78369 228 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 CYP4X1Q8N118 509 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 TIMP2P16035 220 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 CBLBQ13191 982 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 NR5A1Q13285 461 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 DKK1O94907 266 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 ERVK-9P63128 1117 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-387P-201ENST00000411331 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms