RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 PDCP20941 246 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 IDI1Q13907 227 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 NME9Q86XW9 330 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 IFT57Q9NWB7 429 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP4-202ENST00000392011 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 BTBD11A6QL63 1104 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K1Q13233 1512 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 STK3Q13188 491 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 SPG7Q9UQ90 795 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 CD109Q6YHK3 1445 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 AACSQ86V21 672 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 GRIN2AQ12879 1464 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 KINO60870 393 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM5Q9C035 493 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 XBP1P17861 261 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPY26PQ9H489 355 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRL1O94910 1474 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 OLFM4Q6UX06 510 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 MCM4P33991 863 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 STK38Q15208 465 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 MPNDQ8N594 471 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 F6X3S4 739 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 CUL7Q14999 1698 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 PDILTQ8N807 584 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-202ENST00000392011 IL27Q8NEV9 243 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM27P14373 513 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD1Q15327 319 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXO3O43524 673 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 GPS2Q13227 327 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC11Q96J66 1382 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 NOS1P29475 1434 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPRKQ15262 1439 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 FBLN1P23142 703 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 MNS1Q8NEH6 495 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-202ENST00000392011 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.49■□□□□ 0.87
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