RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 ORAI2Q96SN7 254 aa8.93□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.93□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.93□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 FOXO3O43524 673 aa8.92□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 RIPK4P57078 832 aa8.92□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 NEUROD2Q15784 382 aa8.92□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 USP19O94966 1318 aa8.91□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 FBLN1P23142 703 aa8.91□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 HOXC9P31274 260 aa8.91□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 IP6K1Q92551 441 aa8.91□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 SLIT3O75094 1523 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 SOX12O15370 315 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 HMOX1P09601 288 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF428Q96B54 188 aa8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
KCNQ1-204ENST00000380776 NFAT5O94916 1531 aa8.9□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 KDRP35968 1356 aa8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 GCP02774 474 aa8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 GNAI1P63096 354 aa8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 SLAIN2Q9P270 581 aa8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 ABCC6O95255 1503 aa8.89□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 PEAK1Q9H792 1746 aa8.88□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 MS4A1P11836 297 aa8.88□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.88□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 IFT57Q9NWB7 429 aa8.88□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.88□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.88□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 ALS2Q96Q42 1657 aa8.88□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.87□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 AAMPQ13685 434 aa8.87□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 BRINP3Q76B58 766 aa8.87□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 EYA1Q99502 592 aa8.87□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.86□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 LTN1O94822 1766 aa8.86□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 PXDNQ92626 1479 aa8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 PDE3AQ14432 1141 aa8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 CFAP44Q96MT7 982 aa8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.85□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.84□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.84□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.84□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 CPDO75976 1380 aa8.84□□□□□ -0.99
KCNQ1-204ENST00000380776 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF853P0CG23 659 aa8.83□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.83□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.83□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 KIF16BQ96L93 1317 aa8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 NCAPD2Q15021 1401 aa8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.82□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 KIAA0232Q92628 1395 aa8.81□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 MAP3K5Q99683 1374 aa8.81□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 ERBB3P21860 1342 aa8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 CHL1O00533 1208 aa8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 NBPF4Q96M43 638 aa8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.8□□□□□ -1
KCNQ1-204ENST00000380776 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms