RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.54■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 LNPKQ9C0E8 428 aa16.54■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 DLC1Q96QB1 1528 aa16.54■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 FSD2A1L4K1 749 aa16.54■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF428Q96B54 188 aa16.54■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 VAMP4O75379 141 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 IL13P35225 146 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 GNAI1P63096 354 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 TSPYL6Q8N831 410 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 COG3Q96JB2 828 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 NUCB1Q02818 461 aa16.52■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TMOD1-202ENST00000375175 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 IFT57Q9NWB7 429 aa16.51■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CHD1LQ86WJ1 897 aa16.51■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.51■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 MBIPQ9NS73 344 aa16.51■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 METP08581 1390 aa16.51■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.5■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.49■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 AGLP35573 1532 aa16.49■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.49■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.49■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.48■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.48■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.48■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.48■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 MCM4P33991 863 aa16.48■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 FAM83GA6ND36 823 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 DIP2BQ9P265 1576 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF853P0CG23 659 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 DCTN1Q14203 1278 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CFAP44Q96MT7 982 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 HSCBQ8IWL3 235 aa16.46■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 GCC1Q96CN9 775 aa16.46■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 REREQ9P2R6 1566 aa16.46■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.46■□□□□ 0.23
TMOD1-202ENST00000375175 ERBB4Q15303 1308 aa16.45■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 CPS1P31327 1500 aa16.44■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 PTCH1Q13635 1447 aa16.43■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.43■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.43■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ABCC4O15439 1325 aa16.42■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 NUTM2FA1L443 756 aa16.42■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 TRAK2O60296 914 aa16.42■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.42■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 PIK3R4Q99570 1358 aa16.42■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 ESPNB1AK53 854 aa16.42■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 MRE11P49959 708 aa16.42■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.41■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.41■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 SIRT1Q96EB6 747 aa16.41■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 RBM25P49756 843 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.41■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.4■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.4■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 GRPEL1Q9HAV7 217 aa16.4■□□□□ 0.22
TMOD1-202ENST00000375175 SOX12O15370 315 aa16.38■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.38■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MCM10Q7L590 875 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ITSN1Q15811 1721 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 KRT24Q2M2I5 525 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ACEP12821 1306 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TNRQ92752 1358 aa16.36■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.36■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SNX21Q969T3 373 aa16.36■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TECPR2O15040 1411 aa16.36■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 AKAP12Q02952 1782 aa16.35■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 C3P01024 1663 aa16.35■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.35■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.34■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.34■□□□□ 0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CHL1O00533 1208 aa16.33■□□□□ 0.2
TMOD1-202ENST00000375175 CDC45O75419 566 aa16.33■□□□□ 0.2
TMOD1-202ENST00000375175 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
TMOD1-202ENST00000375175 DCTPP1Q9H773 170 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms