RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372621.8

CTPS1-202, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-202ENST00000372621 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 TSPYL6Q8N831 410 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 AKAP12Q02952 1782 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 DIP2BQ9P265 1576 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 LNPKQ9C0E8 428 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 GNAI1P63096 354 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 ABCC4O15439 1325 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 C3P01024 1663 aa16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 MBIPQ9NS73 344 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 CPS1P31327 1500 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 MCM4P33991 863 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 NME9Q86XW9 330 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 GCC1Q96CN9 775 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 DDIT3P35638 169 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CTPS1-202ENST00000372621 METP08581 1390 aa16.02■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 SNX21Q969T3 373 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 TSPOAP1O95153 1857 aa16■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 CFAP44Q96MT7 982 aa16■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 TECPR2O15040 1411 aa16■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 NRKQ7Z2Y5 1582 aa16■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 ITSN1Q15811 1721 aa16■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 HSCBQ8IWL3 235 aa15.99■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 SIRT1Q96EB6 747 aa15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 KIF2CQ99661 725 aa15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.97■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 FSD2A1L4K1 749 aa15.97■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.97■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 COG3Q96JB2 828 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.96■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTPS1-202ENST00000372621 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 FAM83GA6ND36 823 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.94■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 TRAK2O60296 914 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 RGS12O14924 1447 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 DCTN1Q14203 1278 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.148e-6■■■□□ 17.3
CTPS1-202ENST00000372621 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 DCTPP1Q9H773 170 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 PEAK1Q9H792 1746 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 ATP10DQ9P241 1426 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-202ENST00000372621 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 MLECQ14165 292 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 CHL1O00533 1208 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 CDC45O75419 566 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 KIAA0232Q92628 1395 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.87■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.86■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.86■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.86■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 KRT24Q2M2I5 525 aa15.85■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.85■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CTPS1-202ENST00000372621 TTC22Q5TAA0 569 aa15.85■□□□□ 0.13
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