RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD21O60216 631 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR3C2P08235 984 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF5Q13568 498 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF592Q92610 1267 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 POM121Q96HA1 1249 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 AAASQ9NRG9 546 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.65□□□□□ -1.34
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RNU6-552P-201ENST00000362869 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMP2P16035 220 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB15P59190 212 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 VAC14Q08AM6 782 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 WASHC4Q2M389 1173 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 WWC1Q8IX03 1113 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.64□□□□□ -1.35
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RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
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RNU6-552P-201ENST00000362869 ESPNB1AK53 854 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMP1P13497 986 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 DACH1Q9UI36 760 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF20Q5VTR2 975 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX11P35716 441 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC125Q86Z20 511 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEIOBQ8N635 442 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.58□□□□□ -1.36
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RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM52Q96A61 297 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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RNU6-552P-201ENST00000362869 SCARF1Q14162 830 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 SENP2Q9HC62 589 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYLDQ9NQC7 956 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.56□□□□□ -1.36
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RNU6-552P-201ENST00000362869 POM121CA8CG34 1229 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF787Q6DD87 383 aa6.55□□□□□ -1.36
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RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF135Q8IUD6 432 aa6.55□□□□□ -1.36
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RNU6-552P-201ENST00000362869 POTECB2RU33 542 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 LILRA1O75019 489 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMP2P12643 396 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.54□□□□□ -1.36
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RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM47Q96LD4 638 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFP42Q96MM3 310 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADH1AP07327 375 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERVK-9P63128 1117 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-552P-201ENST00000362869 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCTRP47872 440 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 RELBQ01201 579 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLMNQ92990 594 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3CDO00329 1044 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPINT1O43278 529 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAK2O60296 914 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.49□□□□□ -1.37
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