RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362802.1

RNU4-21P-201, Transcript of RNA, U4 small nuclear 21, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU4-21P, Length 126 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU4-21P-201ENST00000362802 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 BMP1P13497 986 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 TIMP2P16035 220 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 ITPKCQ96DU7 683 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 NR1H3Q13133 447 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 MCM6Q14566 821 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 ABL2P42684 1182 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 GPR37L1O60883 481 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 SENP2Q9HC62 589 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU4-21P-201ENST00000362802 SCARF1Q14162 830 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 UPP2O95045 317 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF592Q92610 1267 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 FLIIQ13045 1269 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 KIFC2Q96AC6 838 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 BMP2P12643 396 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 TRIM47Q96LD4 638 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZFP42Q96MM3 310 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 RAD21O60216 631 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 VAC14Q08AM6 782 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 CBLBQ13191 982 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 IRF5Q13568 498 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 ESPNB1AK53 854 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 WWC1Q8IX03 1113 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 MEIOBQ8N635 442 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 COG6Q9Y2V7 657 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 RNF20Q5VTR2 975 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 POM121Q96HA1 1249 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 CYLDQ9NQC7 956 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU4-21P-201ENST00000362802 WASHC4Q2M389 1173 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 TRIM52Q96A61 297 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 RELBQ01201 579 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 Q6ZVU0 165 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 MAN1A2O60476 641 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 SEMA3FQ13275 785 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 SOBPA7XYQ1 873 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 LILRA1O75019 489 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 CCDC125Q86Z20 511 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 ADH1AP07327 375 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RNU4-21P-201ENST00000362802 RNF135Q8IUD6 432 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 TTLL8A6PVC2 850 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 SPINT1O43278 529 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 SOX11P35716 441 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 PTGIRP43119 386 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 SCTRP47872 440 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 ERVK-9P63128 1117 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 MEN1O00255 615 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU4-21P-201ENST00000362802 POM121CA8CG34 1229 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU4-21P-201ENST00000362802 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 323 ms