RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 LNPKQ9C0E8 428 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 DIP2BQ9P265 1576 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 HMOX1P09601 288 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 IL13P35225 146 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 ITSN1Q15811 1721 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 AKAP12Q02952 1782 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF853P0CG23 659 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 FBLN1P23142 703 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC4O15439 1325 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 C3P01024 1663 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 MCM4P33991 863 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 MBIPQ9NS73 344 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 SNX21Q969T3 373 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 NME9Q86XW9 330 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 TSPYL6Q8N831 410 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 CPS1P31327 1500 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 TECPR2O15040 1411 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP44Q96MT7 982 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 TSPOAP1O95153 1857 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 COG3Q96JB2 828 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 METP08581 1390 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 DDIT3P35638 169 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 SIRT1Q96EB6 747 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 FSD2A1L4K1 749 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS3-201ENST00000355530 TRAK2O60296 914 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 KIF2CQ99661 725 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 FAM83GA6ND36 823 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 CDC45O75419 566 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
SPNS3-201ENST00000355530 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 RGS12O14924 1447 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 MLECQ14165 292 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 ATP10DQ9P241 1426 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 DCTN1Q14203 1278 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 GBP4Q96PP9 640 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 DCTPP1Q9H773 170 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA0232Q92628 1395 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 PTMSP20962 102 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 PEAK1Q9H792 1746 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 MRE11P49959 708 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SPNS3-201ENST00000355530 PTPRCP08575 1304 aa22.64■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 CHL1O00533 1208 aa22.64■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms