RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 NFAT5O94916 1531 aa20.31■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 WDR63Q8IWG1 891 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 PRKAR2BP31323 418 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 NEUROD2Q15784 382 aa20.3■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 SLIT3O75094 1523 aa20.29■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 RTL1A6NKG5 1358 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 HMOX1P09601 288 aa20.28■□□□□ 0.84
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LIMS1-202ENST00000338045 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.28■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 USP19O94966 1318 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 ALS2Q96Q42 1657 aa20.27■□□□□ 0.84
LIMS1-202ENST00000338045 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.26■□□□□ 0.83
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LIMS1-202ENST00000338045 LTN1O94822 1766 aa20.23■□□□□ 0.83
LIMS1-202ENST00000338045 RIPK4P57078 832 aa20.23■□□□□ 0.83
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LIMS1-202ENST00000338045 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.22■□□□□ 0.83
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LIMS1-202ENST00000338045 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-202ENST00000338045 SLAIN2Q9P270 581 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-202ENST00000338045 IL16Q14005 1332 aa20.21■□□□□ 0.83
LIMS1-202ENST00000338045 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 EYA1Q99502 592 aa20.19■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.18■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.17■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-202ENST00000338045 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-202ENST00000338045 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-202ENST00000338045 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-202ENST00000338045 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-202ENST00000338045 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-202ENST00000338045 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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LIMS1-202ENST00000338045 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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LIMS1-202ENST00000338045 ZNF853P0CG23 659 aa20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 NBPF4Q96M43 638 aa20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 IFT57Q9NWB7 429 aa20.07■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 PLIN1O60240 522 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 PLEKHG5O94827 1062 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 CPDO75976 1380 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.06■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 COL18A1P39060 1754 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 FAM83GA6ND36 823 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 GNAI1P63096 354 aa20.05■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 BCAR3O75815 825 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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LIMS1-202ENST00000338045 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.04■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 CFAP44Q96MT7 982 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 ERBB3P21860 1342 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.03■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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LIMS1-202ENST00000338045 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.02■□□□□ 0.8
LIMS1-202ENST00000338045 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.02■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 BCL11AQ9H165 835 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 RGPD5Q99666 1765 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 CRB1P82279 1406 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 EXOC6Q8TAG9 804 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 KIAA0232Q92628 1395 aa19.99■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.99■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 MBIPQ9NS73 344 aa19.99■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 MCM10Q7L590 875 aa19.99■□□□□ 0.79
LIMS1-202ENST00000338045 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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