RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 NCLP19338 710 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A1W2PP64 1363 aa24.99■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 RBSNQ9H1K0 784 aa24.98■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.98■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 MCM5P33992 734 aa24.97■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.97■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 CABP2Q9NPB3 220 aa24.96■■□□□ 1.59
PPP1CC-201ENST00000335007 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.95■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.94■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCC4O15439 1325 aa24.93■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.93■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.93■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 UQCRHP07919 91 aa24.93■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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PPP1CC-201ENST00000335007 FCHSD2O94868 740 aa24.91■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 USP26Q9BXU7 913 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 ZFYVE9O95405 1425 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 DYNC1I1O14576 645 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 VAMP4O75379 141 aa24.9■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.89■■□□□ 1.58
PPP1CC-201ENST00000335007 ST18O60284 1047 aa24.89■■□□□ 1.58
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PPP1CC-201ENST00000335007 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.89■■□□□ 1.58
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PPP1CC-201ENST00000335007 PKP1Q13835 747 aa24.88■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 FYB1O15117 783 aa24.87■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.87■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.86■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.86■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.86■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.85■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 CASC1Q6TDU7 716 aa24.85■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.85■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
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PPP1CC-201ENST00000335007 DCTPP1Q9H773 170 aa24.83■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.83■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 PIK3C2BO00750 1634 aa24.83■■□□□ 1.57
PPP1CC-201ENST00000335007 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 MBD3O95983 291 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 IFT57Q9NWB7 429 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 NFE2L2Q16236 605 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.82■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 TSPYL6Q8N831 410 aa24.81■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.81■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 SYCE3A1L190 88 aa24.81■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 REC8O95072 547 aa24.78■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 ASXL2Q76L83 1435 aa24.77■■□□□ 1.56
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF853P0CG23 659 aa24.76■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 MBIPQ9NS73 344 aa24.76■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 SDSP20132 328 aa24.75■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCC3O15438 1527 aa24.74■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.74■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 TSPY26PQ9H489 355 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPRMP28827 1452 aa24.73■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP10DQ9P241 1426 aa24.72■■□□□ 1.55
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