RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 TECPR2O15040 1411 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 GCC1Q96CN9 775 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC4O15439 1325 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 C3P01024 1663 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP12Q02952 1782 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 SIRT1Q96EB6 747 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXD1-201ENST00000331462 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.33■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 SNX21Q969T3 373 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 CPS1P31327 1500 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 HMOX1P09601 288 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 FBLN1P23142 703 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 LNPKQ9C0E8 428 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 MCM4P33991 863 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 HSCBQ8IWL3 235 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 MBIPQ9NS73 344 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 NME9Q86XW9 330 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 TSPYL6Q8N831 410 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP44Q96MT7 982 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 METP08581 1390 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 ITSN1Q15811 1721 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 DDIT3P35638 169 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD1-201ENST00000331462 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 COG3Q96JB2 828 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 FAM43AQ8N2R8 423 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD1-201ENST00000331462 FSD2A1L4K1 749 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 TSPOAP1O95153 1857 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 KIF2CQ99661 725 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD1-201ENST00000331462 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 TRAK2O60296 914 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 RGS12O14924 1447 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0232Q92628 1395 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 FAM83GA6ND36 823 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 CDC45O75419 566 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 ATP10DQ9P241 1426 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 DCTPP1Q9H773 170 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD1-201ENST00000331462 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 CHL1O00533 1208 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 TNRQ92752 1358 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 DCTN1Q14203 1278 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 PEAK1Q9H792 1746 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 USP31Q70CQ4 1352 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRCP08575 1304 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 MLECQ14165 292 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms