RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.49■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 ATF3P18847 181 aa36.48■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.48■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 FOXO3O43524 673 aa36.47■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 PHACTR3Q96KR7 559 aa36.47■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 MST1RQ04912 1400 aa36.46■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 MYH16Q9H6N6 1097 aa36.46■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 AMPHP49418 695 aa36.45■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 NFE2L2Q16236 605 aa36.45■■■■□ 3.43
CCZ1-201ENST00000325974 IL16Q14005 1332 aa36.44■■■■□ 3.42
CCZ1-201ENST00000325974 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CCZ1-201ENST00000325974 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CCZ1-201ENST00000325974 PLIN1O60240 522 aa36.42■■■■□ 3.42
CCZ1-201ENST00000325974 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.4■■■■□ 3.42
CCZ1-201ENST00000325974 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.39■■■■□ 3.42
CCZ1-201ENST00000325974 ARHGEF10O15013 1369 aa36.39■■■■□ 3.42
CCZ1-201ENST00000325974 DLG5Q8TDM6 1919 aa36.38■■■■□ 3.42
CCZ1-201ENST00000325974 MSH6P52701 1360 aa36.38■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 LTN1O94822 1766 aa36.38■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 NFAT5O94916 1531 aa36.38■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.37■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 HOXC9P31274 260 aa36.36■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa36.36■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.36■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 RTL1A6NKG5 1358 aa36.35■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.34■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 EXOC6Q8TAG9 804 aa36.34■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 FANCIQ9NVI1 1328 aa36.33■■■■□ 3.41
CCZ1-201ENST00000325974 SLIT3O75094 1523 aa36.3■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 BCAR3O75815 825 aa36.3■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 LMOD3Q0VAK6 560 aa36.3■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.3■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 KDRP35968 1356 aa36.28■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 ALS2Q96Q42 1657 aa36.27■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 EYA1Q99502 592 aa36.27■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CCZ1-201ENST00000325974 C20orf194Q5TEA3 1177 aa36.26■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC136Q96JN2 1154 aa36.26■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 RARSP54136 660 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 IP6K1Q92551 441 aa36.25■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 CRBNQ96SW2 442 aa36.25■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 USP19O94966 1318 aa36.25■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.23■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 GCP02774 474 aa36.22■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.21■■■■□ 3.39
CCZ1-201ENST00000325974 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
CCZ1-201ENST00000325974 IFT57Q9NWB7 429 aa36.18■■■■□ 3.38
CCZ1-201ENST00000325974 GNAI1P63096 354 aa36.16■■■■□ 3.38
CCZ1-201ENST00000325974 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.16■■■■□ 3.38
CCZ1-201ENST00000325974 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CCZ1-201ENST00000325974 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF853P0CG23 659 aa36.15■■■■□ 3.38
CCZ1-201ENST00000325974 FAM83GA6ND36 823 aa36.14■■■■□ 3.38
CCZ1-201ENST00000325974 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 PXDNQ92626 1479 aa36.13■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 PDE3AQ14432 1141 aa36.12■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 CFAP44Q96MT7 982 aa36.11■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.1■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 CANXP27824 592 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.09■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 DCTN1Q14203 1278 aa36.09■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 BRINP3Q76B58 766 aa36.09■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 PLEKHG5O94827 1062 aa36.08■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.08■■■■□ 3.37
CCZ1-201ENST00000325974 BCL2L13Q9BXK5 485 aa36.07■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 SLAIN2Q9P270 581 aa36.06■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 MBIPQ9NS73 344 aa36.06■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.04■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.04■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 NBPF6Q5VWK0 638 aa36.02■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF428Q96B54 188 aa36.02■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 NBPF4Q96M43 638 aa36.02■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 MCM10Q7L590 875 aa36.01■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 SSH1Q8WYL5 1049 aa36.01■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 SMC4Q9NTJ3 1288 aa36.01■■■■□ 3.36
CCZ1-201ENST00000325974 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.99■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 RGPD5Q99666 1765 aa35.98■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.98■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 CRB1P82279 1406 aa35.97■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 PANK1Q8TE04 598 aa35.97■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 CHL1O00533 1208 aa35.96■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa35.96■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.96■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 NCAPD2Q15021 1401 aa35.96■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 VAMP4O75379 141 aa35.95■■■■□ 3.35
CCZ1-201ENST00000325974 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms