RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307227.9

SUCLG2-201, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-201ENST00000307227 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 C14orf37Q86TY3 774 aa16.12■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.11■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 NWD1Q149M9 1564 aa16.11■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.11■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 CABP1Q9NZU7 370 aa16.11■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.11■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.1■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 ATP7BP35670 1465 aa16.1■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 FYB1O15117 783 aa16.08■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SUCLG2-201ENST00000307227 IL16Q14005 1332 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 RIPK4P57078 832 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 SMC5Q8IY18 1101 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.05■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.05■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 TMEM94Q12767 1356 aa16.05■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.04■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.03■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 MCM4P33991 863 aa16.03■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 KIF16BQ96L93 1317 aa16.03■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.02■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.02■□□□□ 0.16
SUCLG2-201ENST00000307227 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.01■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.01■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.01■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 NUCB1Q02818 461 aa16.01■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.01■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 C19orf44Q9H6X5 657 aa16■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 HSCBQ8IWL3 235 aa15.99■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 LNPKQ9C0E8 428 aa15.99■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.99■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 ACEP12821 1306 aa15.99■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 FCHSD2O94868 740 aa15.99■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 ITSN1Q15811 1721 aa15.98■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.98■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 ATF3P18847 181 aa15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 PRKAR2BP31323 418 aa15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 ARXQ96QS3 562 aa15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.97■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 AKAP12Q02952 1782 aa15.96■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.96■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 FSD2A1L4K1 749 aa15.96■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 FBLN1P23142 703 aa15.96■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.96■□□□□ 0.15
SUCLG2-201ENST00000307227 TRAK2O60296 914 aa15.95■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.95■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 MSH6P52701 1360 aa15.95■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 ZNF428Q96B54 188 aa15.94■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 ORAI2Q96SN7 254 aa15.94■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 POLKQ9UBT6 870 aa15.94■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.94■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.94■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 SNX21Q969T3 373 aa15.94■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 VAMP4O75379 141 aa15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 DDIT3P35638 169 aa15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 USP6P35125 1406 aa15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 SSH2Q76I76 1423 aa15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 BMP2KLQ5H9B9 411 aa15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.93■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 HMOX1P09601 288 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 NFE2L2Q16236 605 aa15.92■□□□□ 0.14
SUCLG2-201ENST00000307227 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms