RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 SLIT1O75093 1534 aa35.31■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.31■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 NUCB1Q02818 461 aa35.3■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.3■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 LTKP29376 864 aa35.29■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP45Q92619 1136 aa35.29■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.29■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 PIK3R4Q99570 1358 aa35.28■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 PTCH1Q13635 1447 aa35.27■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 IFT57Q9NWB7 429 aa35.26■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 GNAI1P63096 354 aa35.26■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 BRPF3Q9ULD4 1205 aa35.26■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 IL13P35225 146 aa35.24■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.24■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.24■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 VAMP4O75379 141 aa35.23■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 HMOX1P09601 288 aa35.21■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.21■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 CHD1LQ86WJ1 897 aa35.21■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 ZNF853P0CG23 659 aa35.2■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 EID1Q9Y6B2 187 aa35.2■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.2■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 FBLN1P23142 703 aa35.2■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.2■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 GCC1Q96CN9 775 aa35.19■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 AKAP12Q02952 1782 aa35.17■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.17■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 NME9Q86XW9 330 aa35.16■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 RBM25P49756 843 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 ITSN1Q15811 1721 aa35.14■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 BMP2KLQ5H9B9 411 aa35.14■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 LNPKQ9C0E8 428 aa35.14■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 ABCC4O15439 1325 aa35.14■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 COG3Q96JB2 828 aa35.13■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 MBIPQ9NS73 344 aa35.13■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 CHMP5Q9NZZ3 219 aa35.13■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 PTPRUQ92729 1446 aa35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 CFAP44Q96MT7 982 aa35.12■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.12■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 HSCBQ8IWL3 235 aa35.11■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 TSPYL6Q8N831 410 aa35.11■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.11■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 DIP2AQ14689 1571 aa35.11■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.09■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 TBX22Q9Y458 520 aa35.09■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.08■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 SNX21Q969T3 373 aa35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.06■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 MCM4P33991 863 aa35.05■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.04■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD45Q5TZF3 282 aa35.04■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.04■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.03■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa35.02■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 C8orf58Q8NAV2 365 aa35■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 SIRT2Q8IXJ6 389 aa34.98■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 C1orf115Q9H7X2 142 aa34.98■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.97■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.97■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 DDIT3P35638 169 aa34.95■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 FAM83GA6ND36 823 aa34.91■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.9■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 DDX11L8A8MPP1 907 aa34.9■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 FAM43AQ8N2R8 423 aa34.9■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa34.9■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.88■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.87■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.87■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 KIF2CQ99661 725 aa34.87■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0232Q92628 1395 aa34.86■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.86■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 CDC45O75419 566 aa34.85■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 DCTN1Q14203 1278 aa34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms