RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CNTROBQ8N137 903 aa14.82□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FYB1O15117 783 aa14.81□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.81□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.81□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CEP170Q5SW79 1584 aa14.81□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.81□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BCAR3O75815 825 aa14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MCTP1Q6DN14 999 aa14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CHRNA2Q15822 529 aa14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.8□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GCC1Q96CN9 775 aa14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CDC45O75419 566 aa14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TBX22Q9Y458 520 aa14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ABCC11Q96J66 1382 aa14.79□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.78□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ATP10AO60312 1499 aa14.78□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DCTN1Q14203 1278 aa14.78□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.78□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZPR1O75312 459 aa14.78□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.78□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HIP1O00291 1037 aa14.77□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IFT57Q9NWB7 429 aa14.77□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.77□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.77□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SIL1Q9H173 461 aa14.77□□□□□ -0.04
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.77□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SRGAP3O43295 1099 aa14.76□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.76□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCDC184Q52MB2 194 aa14.76□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.76□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KCNA6P17658 529 aa14.75□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.75□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.75□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.75□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PHF14O94880 888 aa14.74□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PBRM1Q86U86 1689 aa14.74□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLFN5Q08AF3 891 aa14.74□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.74□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.74□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PSMA5P28066 241 aa14.73□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.73□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.73□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.72□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.72□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.72□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.72□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NEO1Q92859 1461 aa14.71□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.71□□□□□ -0.05
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.7□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.7□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.7□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.7□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C8orf37Q96NL8 207 aa14.7□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.7□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.69□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HYPKQ9NX55 129 aa14.69□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AACSQ86V21 672 aa14.69□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.69□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MTMR7Q9Y216 660 aa14.68□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 XBP1P17861 261 aa14.68□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ATP7AQ04656 1500 aa14.68□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms