RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 NWD1Q149M9 1564 aa24.14■■□□□ 1.45
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SIKE1-201ENST00000060969 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-201ENST00000060969 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.11■■□□□ 1.45
SIKE1-201ENST00000060969 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
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SIKE1-201ENST00000060969 KRT24Q2M2I5 525 aa23.82■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.82■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 CRB1P82279 1406 aa23.82■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 SLIT3O75094 1523 aa23.82■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 CHL1O00533 1208 aa23.81■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 DCCP43146 1447 aa23.8■■□□□ 1.4
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