RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FBXL18Q96ME1 805 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 OMDQ99983 421 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GMIPQ9P107 970 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM38O00635 465 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BANF1O75531 89 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 COX7A2P14406 83 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TACR2P21452 398 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TRPC1P48995 793 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CCL23P55773 120 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IQCKQ8N0W5 287 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CPA6Q8N4T0 437 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 USP7Q93009 1102 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CDRT15Q96T59 188 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEH1Q9H213 219 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM50BQ9Y247 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 INVSQ9Y283 1065 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MYH1P12882 1939 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CA12O43570 354 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TPST1O60507 370 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CXCL14O95715 111 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CLPTM1O96005 669 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MC4RP32245 332 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LILRA4P59901 499 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF544Q6NX49 715 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PMF1Q6P1K2 205 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM228AQ86W67 206 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLCO2A1Q92959 643 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RNF19AQ9NV58 838 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PLLPQ9Y342 182 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TJP1Q07157 1748 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GRIN2DO15399 1336 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GPR1P46091 355 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CACNG1Q06432 222 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TNK2Q07912 1038 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BST1Q10588 318 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GALNT3Q14435 633 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 AAGABQ6PD74 315 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CPT1BQ92523 772 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BBS4Q96RK4 519 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RTKNQ9BST9 563 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 VWA7Q9Y334 891 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PLIN5Q00G26 463 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLC20A2Q08357 652 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TAF10Q12962 218 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NCF4Q15080 339 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IFNL1Q8IU54 200 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.5□□□□□ -1.37
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