RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 POLQO75417 2590 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CFAP69A5D8W1 941 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MUSKO15146 869 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MED7O43513 233 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PRAMEF10O60809 474 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF202O95125 648 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCDH8O95206 1070 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADCY5O95622 1261 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CALCAP01258 141 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ALPIP09923 528 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF18P17022 549 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NUCB2P80303 420 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 B4GALNT1Q00973 533 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ELOCQ15369 112 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ALG11Q2TAA5 492 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CARD16Q5EG05 197 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RETSATQ6NUM9 610 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TTI2Q6NXR4 508 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NLRP14Q86W24 1093 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LMX1AQ8TE12 382 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SHC3Q92529 594 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MUC3BQ9H195 1237 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DYRK4Q9NR20 520 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DACH1Q9UI36 760 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GGT7Q9UJ14 662 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 M0QYT0 321 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TNFRSF10CO14798 259 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 F9P00740 461 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ANXA6P08133 673 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RHOCP08134 193 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRIM23P36406 574 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ETV5P41161 510 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCL7P80098 99 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NFKB2Q00653 900 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC6A3Q01959 620 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GNA12Q03113 381 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PPARDQ03181 441 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KCNAB2Q13303 367 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SGCGQ13326 291 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NFATC4Q14934 902 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KCTD16Q68DU8 428 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BORAQ6PGQ7 559 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LINGO4Q6UY18 593 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RRAGAQ7L523 313 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCNJLQ8IV13 435 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NKD1Q969G9 470 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RNF34Q969K3 372 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MIB2Q96AX9 1013 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM81BQ96LP2 452 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CATSPER2Q96P56 530 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DDA1Q9BW61 102 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms