RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	PCCB	P05166	539 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	HGF	P14210	728 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	PTPN9	P43378	593 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	RPIA	P49247	311 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CCL7	P80098	99 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SPIDR	Q14159	915 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	INPP5A	Q14642	412 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	KRT31	Q15323	416 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	KY	Q8NBH2	561 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	STAT1	P42224	750 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	PDX1	P52945	283 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	JAM2	P57087	298 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	YPEL5	P62699	121 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC14	Q15048	493 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SYCP1	Q15431	976 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	TGIF1	Q15583	401 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	MACC1	Q6ZN28	852 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	JAML	Q86YT9	394 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	APOO	Q9BUR5	198 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	C6	P13671	934 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	RGR	P47804	291 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	LIG3	P49916	1009 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	HK3	P52790	923 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	UCN	P55089	124 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	RHD	Q02161	417 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CLN3	Q13286	438 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SERINC3	Q13530	473 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ARL14	Q8N4G2	192 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	KALRN	O60229	2985 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PQM1	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	EFS	O43281	561 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	RASGRP1	O95267	797 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	OGDH	Q02218	1023 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	ELOC	Q15369	112 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	CA9	Q16790	459 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TCF4-262	ENST00000628078	UGP2	Q16851	508 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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