RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-210ENST00000619438 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 RNF43Q68DV7 783 aa21.8■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 UNC5AQ6ZN44 842 aa21.8■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.8■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 PIAS1O75925 651 aa21.77■■□□□ 1.08
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SGMS1-210ENST00000619438 CHSY1Q86X52 802 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 FAM72BQ86X60 149 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 CIPCQ9C0C6 399 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 WDCPQ9H6R7 721 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM51Q9NW97 253 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.77■■□□□ 1.08
SGMS1-210ENST00000619438 LILRB5O75023 590 aa21.76■■□□□ 1.07
SGMS1-210ENST00000619438 MX2P20592 715 aa21.76■■□□□ 1.07
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