RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613488.2

CU639417.2-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CU639417.2, Length 4,705 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.2-201ENST00000613488 UQCRBP14927 111 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PARP8Q8N3A8 854 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 DHRS12A0PJE2 317 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 HPCAP84074 193 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 DUSP28Q4G0W2 176 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 FAM9CQ8IZT9 166 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 FAM47BQ8NA70 645 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 FBXL18Q96ME1 805 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PSMD13Q9UNM6 376 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 CTPS1P17812 591 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 NMBRP28336 390 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 HBEGFQ99075 208 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 MYBPHLA2RUH7 354 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 NRP2O60462 931 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ICAM3P32942 547 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 GPR158Q5T848 1215 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 DET1Q7L5Y6 550 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 STX19Q8N4C7 294 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TMEM159Q96B96 161 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 RTKNQ9BST9 563 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TIMM22Q9Y584 194 aa15.6■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 AP2A1O95782 977 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 LYNP07948 512 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 LIMK2P53671 638 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 RGS14O43566 566 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 GCATO75600 419 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 KLRC2P26717 231 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PIK3CGP48736 1102 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 NR1H2P55055 460 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 C21orf59P57076 290 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 GPX6P59796 221 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 LILRA4P59901 499 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 BLMHQ13867 455 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 FAM149AA5PLN7 773 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TYMPP19971 482 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 MSH3P20585 1137 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PRKG2Q13237 762 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 LMO3Q8TAP4 145 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 RDH11Q8TC12 318 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 YME1L1Q96TA2 773 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 STK25O00506 426 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 HOXA2O43364 376 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 AHCYL1O43865 530 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 TLR5O60602 858 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 VPS4BO75351 444 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 VCLP18206 1134 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 PTPN9P43378 593 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ACSM2AQ08AH3 577 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 CNTN1Q12860 1018 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 MPP2Q14168 576 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 UCMAQ8WVF2 138 aa15.59■□□□□ 0.09
CU639417.2-201ENST00000613488 SLCO2A1Q92959 643 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms