RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 NFKBIAP25963 317 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 AP1S1P61966 158 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PTK2BQ14289 1009 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MESDQ14696 234 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ODF2Q5BJF6 829 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ACACBO00763 2458 aa16.24■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD36A6QL64 1941 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TSPAN11A1L157 253 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 NEMP2A6NFY4 417 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RAD51BO15315 384 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 NEBLO76041 1014 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 CDK4P11802 303 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MAN1A1P33908 653 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RGRP47804 291 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MMRN1Q13201 1228 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MARC1Q5VT66 337 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SARM1Q6SZW1 724 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PARGQ86W56 976 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TSC1Q92574 1164 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF670Q9BS34 389 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDH12Q9NPG4 1184 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SHROOM3Q8TF72 1996 aa16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 A0A1W2PQ67 120 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TOR1BO14657 336 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SPINT1O43278 529 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MAFKO60675 156 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PROS1P07225 676 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 CD48P09326 243 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 C1QTNF9P0C862 333 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ITIH2P19823 946 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 DGKAP23743 735 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGAP25P42331 645 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MMP13P45452 471 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 YPEL5P62699 121 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 DAB2P98082 770 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ITKQ08881 620 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 DPYSL3Q14195 570 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC14Q15048 493 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 VOPP1Q96AW1 172 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TOR4AQ9NXH8 423 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.22■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM8BA6NDV4 472 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 FFAR2O15552 330 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RFPL3O75679 317 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 PIAS2O75928 621 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 C1SP09871 688 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LIG3P49916 1009 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM71BQ8TC56 605 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 RFFLQ8WZ73 363 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 CENPTQ96BT3 561 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 INTUQ9ULD6 942 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.21■□□□□ 0.19
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM221BA6H8Z2 402 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 MUSKO15146 869 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 SOCS5O75159 536 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 CSF2P04141 144 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 PRKCGP05129 697 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 ELFN1P0C7U0 828 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 C6P13671 934 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 JUNDP17535 347 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 CKMT2P17540 419 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 MX2P20592 715 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 IL4RP24394 825 aa16.2■□□□□ 0.18
EFTUD2-215ENST00000589825 HTR1BP28222 390 aa16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms