RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.02■■□□□ 1.12
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CAPNS1-205ENST00000588780 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf74Q96LT6 269 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-205ENST00000588780 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.02■■□□□ 1.12
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CAPNS1-205ENST00000588780 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.02■■□□□ 1.12
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CAPNS1-205ENST00000588780 OR1A2Q9Y585 309 aa22.02■■□□□ 1.12
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CAPNS1-205ENST00000588780 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa22■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 KLHL10Q6JEL2 608 aa22■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 ATCAYQ86WG3 371 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF354CQ86Y25 554 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 SLITRK4Q8IW52 837 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 SMARCE1Q969G3 411 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 WDR92Q96MX6 357 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 CATSPER2Q96P56 530 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 TBCBQ99426 244 aa22■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 CLEC18AA5D8T8 446 aa21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 PNLIPP16233 465 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT9P35527 623 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 BIRC2Q13490 618 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 WSCD2Q2TBF2 565 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 ISM2Q6H9L7 571 aa21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 CD160O95971 181 aa21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 DNAI1Q9UI46 699 aa21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 SDK2Q58EX2 2172 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM170AA1A519 330 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-205ENST00000588780 PTK2Q05397 1052 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.96■■□□□ 1.11
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