RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581224.5

TRIM16-222, Transcript of tripartite motif containing 16, human

TSL 3

Gene TRIM16, Length 815 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM16-222	ENST00000581224	GPR22	Q99680	433 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	APOL2	Q9BQE5	337 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224		A0A0D9SEW6	157 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224		A0A1W2PRU2	124 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	LCHN	A4D1U4	455 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	LEFTY2	O00292	366 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	TPP1	O14773	563 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	SOCS5	O75159	536 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	GLP2R	O95838	553 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	STMN1	P16949	149 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CR2	P20023	1033 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	SCNN1B	P51168	640 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	HK2	P52789	917 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	MAX	P61244	160 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	RAD51	Q06609	339 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CNGA3	Q16281	694 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	GPR158	Q5T848	1215 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	DCLK2	Q8N568	766 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CCDC63	Q8NA47	563 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	GPR150	Q8NGU9	434 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	E2F7	Q96AV8	911 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	RMDN1	Q96DB5	314 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CCDC126	Q96EE4	140 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	SNX15	Q9NRS6	342 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	TDP1	Q9NUW8	608 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224		A0A096LPK6	155 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	GRM6	O15303	877 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CCL16	O15467	120 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	GREM1	O60565	184 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	UGT1A9	O60656	530 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	ZMPSTE24	O75844	475 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	IGSF6	O95976	241 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	BPGM	P07738	259 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	FOSL2	P15408	326 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	PSMA3	P25788	255 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	FOXN2	P32314	431 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	NNMT	P40261	264 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	GRIA4	P48058	902 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	RASSF2	P50749	326 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	PTPN5	P54829	565 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	RAB10	P61026	200 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	ERVK-21	P61565	698 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	RHOA	P61586	193 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CYP4F8	P98187	520 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	IFT88	Q13099	833 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	STX3	Q13277	289 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	BMPR2	Q13873	1038 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	GRIN2C	Q14957	1233 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	E2F5	Q15329	346 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CYTH1	Q15438	398 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	KLC3	Q6P597	504 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRIM16-222	ENST00000581224	CES3	Q6UWW8	571 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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