RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 GJB3O75712 270 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 FSBPO95073 299 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 IL1BP01584 269 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CD59P13987 128 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CCNB1P14635 433 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 PRLRP16471 622 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CD27P26842 260 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 BNC1Q01954 994 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SLC14A1Q13336 389 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ZNF235Q14590 738 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 MYLK3Q32MK0 819 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CCDC181Q5TID7 509 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 KIAA0895LQ68EN5 471 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 AADACL2Q6P093 401 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 NPNTQ6UXI9 565 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SLC35F6Q8N357 371 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 RASGEF1CQ8N431 466 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 AADATQ8N5Z0 425 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 NETO2Q8NC67 525 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ACTL9Q8TC94 416 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 VOPP1Q96AW1 172 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 HAUS1Q96CS2 278 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 NUDCD1Q96RS6 583 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 LGMNQ99538 433 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 FERMT1Q9BQL6 677 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 HEMGNQ9BXL5 484 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 HDAC8Q9BY41 377 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TM6SF2Q9BZW4 377 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TNKS2Q9H2K2 1166 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 DKK3Q9UBP4 350 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 LRRK1Q38SD2 2015 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 A0A1B0GVT2 93 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 A0A1W2PQ67 120 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TSPAN11A1L157 253 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CFAP69A5D8W1 941 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 LRRC72A6NJI9 287 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SOCS5O75159 536 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 LEFTY1O75610 366 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 MAP3K6O95382 1288 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 IGHV4-34P06331 123 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CTSLP07711 333 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 UQCRHP07919 91 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ITGB7P26010 798 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SUOXP51687 545 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 AP1B1Q10567 949 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TEAD4Q15561 434 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SLC14A2Q15849 920 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TEX44Q53QW1 395 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SRLQ86TD4 932 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CHST14Q8NCH0 376 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 CCNYQ8ND76 341 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 OR2T34Q8NGX1 318 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 GAREM1Q9H706 876 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SARDHQ9UL12 918 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 SNX12Q9UMY4 172 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 A0A1W2PPC4 97 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 C10orf142B7Z368 130 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 KRIT1O00522 736 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 ENC1O14682 589 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 MUSKO15146 869 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 INSIG1O15503 277 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-209ENST00000580646 BNIP3LO60238 219 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms