RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580419.5

SMARCE1-216, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 1,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SMARCE1-216ENST00000580419 GGT7Q9UJ14 662 aa14.62□□□□□ -0.07
SMARCE1-216ENST00000580419 ITM2BQ9Y287 266 aa14.62□□□□□ -0.07
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SMARCE1-216ENST00000580419 TNFRSF10CO14798 259 aa14.61□□□□□ -0.07
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