RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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CMTM3-211ENST00000565922 LRRD1A4D1F6 860 aa20.04■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 IGLON5A6NGN9 336 aa20.04■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 KDELR1P24390 212 aa20.04■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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CMTM3-211ENST00000565922 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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CMTM3-211ENST00000565922 SAP25Q8TEE9 199 aa20.03■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 FATE1Q969F0 183 aa20.03■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.03■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 IFT43Q96FT9 208 aa20.03■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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CMTM3-211ENST00000565922 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.03■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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CMTM3-211ENST00000565922 MUSKO15146 869 aa20.02■□□□□ 0.8
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CMTM3-211ENST00000565922 RAPGEF5Q92565 580 aa20.02■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 TSGA13Q96PP4 275 aa20.02■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 RNF157Q96PX1 679 aa20.02■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.02■□□□□ 0.8
CMTM3-211ENST00000565922 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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CMTM3-211ENST00000565922 CR2P20023 1033 aa20.01■□□□□ 0.79
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CMTM3-211ENST00000565922 MMP12P39900 470 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 FAM193AP78312 1265 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 SHBQ15464 509 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 TEX26Q8N6G2 289 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 HDAC11Q96DB2 347 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 BMFQ96LC9 184 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
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CMTM3-211ENST00000565922 POM121BA6NF01 834 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 H3BM21 787 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 MATN3O15232 486 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 RAD51BO15315 384 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 TNFSF14O43557 240 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 FTH1P19P0C7X4 201 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 COMTP21964 271 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 CES1P23141 567 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 CDC25BP30305 580 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 YPEL5P62699 121 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 PTK2BQ14289 1009 aa20■□□□□ 0.79
CMTM3-211ENST00000565922 PQLC3Q8N755 202 aa20■□□□□ 0.79
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