RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 A0A1W2PPC4 97 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SLC30A4O14863 429 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MUSKO15146 869 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ALOX15BO15296 676 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SLC31A1O15431 190 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PRAMEF11O60813 436 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PALMO75781 387 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PCDH8O95206 1070 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PIGNO95427 931 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 WNT1P04628 370 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PRLRP16471 622 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CD27P26842 260 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 HTR7P34969 479 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ABL2P42684 1182 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 HCAR3P49019 387 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SEMG2Q02383 582 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GRIK2Q13002 908 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DPYSL3Q14195 570 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TLR1Q15399 786 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CHSY3Q70JA7 882 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CEP76Q8TAP6 659 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 RFFLQ8WZ73 363 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 FZD3Q9NPG1 666 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GGT7Q9UJ14 662 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ITM2BQ9Y287 266 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.33□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 LAMA1P25391 3075 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 A0A1W2PQU0 124 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 TM4SF5O14894 197 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GIPC1O14908 333 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MFSD11O43934 449 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 NDUFA10O95299 355 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 IGSF6O95976 241 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GSRP00390 522 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PRKCGP05129 697 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ADRB3P13945 408 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 COMTP21964 271 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 KDELR1P24390 212 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 DPP6P42658 865 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 MAXP61244 160 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 IL9RQ01113 521 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SPA17Q15506 151 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 KIF19Q2TAC6 998 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GDPD4Q6W3E5 623 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PQLC3Q8N755 202 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 FAM131CQ96AQ9 280 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 SERAC1Q96JX3 654 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.32□□□□□ -1.08
LINS1-211ENST00000560941 PANX2Q96RD6 677 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms