RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 MMP13P45452 471 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 CSNK1DP48730 415 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 MARCKSL1P49006 195 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 BCL2L1Q07817 233 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXC1Q12948 553 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 BNIP3Q12983 259 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 SGCGQ13326 291 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PTPRRQ15256 657 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 UGP2Q16851 508 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 MARC1Q5VT66 337 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 Q6ZSR6 202 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 RFX6Q8HWS3 928 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 BMFQ96LC9 184 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 NOD2Q9HC29 1040 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 ALG6Q9Y672 507 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 A0A0U1RQJ8 604 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 CR2P20023 1033 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC1A1P43005 524 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 RENBPP51606 427 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXK2Q01167 660 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 ITKQ08881 620 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAF2Q12933 501 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 GRM3Q14832 879 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 IQCHQ86VS3 1027 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM139Q8IV31 216 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PLD5Q8N7P1 536 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 CCNYQ8ND76 341 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 MGME1Q9BQP7 344 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 DESI2Q9BSY9 194 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 DTLQ9NZJ0 730 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-211ENST00000559850 A6NNZ2 444 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 APOL1O14791 398 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 FLRT2O43155 660 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CBFA2T3O75081 653 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TM7SF2O76062 418 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KRT10P13645 584 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 C6P13671 934 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CDC25BP30305 580 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 IGFALSP35858 605 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 AP1S1P61966 158 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DSC2Q02487 901 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RALGDSQ12967 914 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 IHHQ14623 411 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 BBS5Q8N3I7 341 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TEX26Q8N6G2 289 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KRT35Q92764 455 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SMIM14Q96QK8 99 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 LGMNQ99538 433 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 SEMA3CQ99985 751 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 CEP41Q9BYV8 373 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNK1O00180 336 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 FPGTO14772 594 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 MATN3O15232 486 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 HLA-DQB2P05538 268 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 ITGAVP06756 1048 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-211ENST00000559850 PMLP29590 882 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms