RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 ILKQ13418 452 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 MYLK3Q32MK0 819 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTA-210ENST00000559586 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 MFSD11O43934 449 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-210ENST00000559586 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 RGRP47804 291 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 VAV2P52735 878 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-210ENST00000559586 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-210ENST00000559586 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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RABGGTA-210ENST00000559586 PPP2CAP67775 309 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 VSIG1Q86XK7 387 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 EID2Q8N6I1 236 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 EXOC2Q96KP1 924 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF157Q96PX1 679 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 DESI2Q9BSY9 194 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-210ENST00000559586 SP110Q9HB58 689 aa20.27■□□□□ 0.84
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RABGGTA-210ENST00000559586 IGSF6O95976 241 aa20.26■□□□□ 0.83
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RABGGTA-210ENST00000559586 ABCG1P45844 678 aa20.26■□□□□ 0.83
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RABGGTA-210ENST00000559586 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF599Q96NL3 588 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SPINT1O43278 529 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SPOPO43791 374 aa20.25■□□□□ 0.83
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RABGGTA-210ENST00000559586 ACADVLP49748 655 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 GSDMDP57764 484 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.25■□□□□ 0.83
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RABGGTA-210ENST00000559586 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PLD5Q8N7P1 536 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.25■□□□□ 0.83
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RABGGTA-210ENST00000559586 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 WNT9AO14904 365 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PSTPIP1O43586 416 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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RABGGTA-210ENST00000559586 KRT1P04264 644 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TNNT1P13805 278 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CKMT2P17540 419 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CSNK1DP48730 415 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC3Q13217 504 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PGBD5Q8N414 524 aa20.24■□□□□ 0.83
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