RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555506.1

KTN1-222, Transcript of kinectin 1, human

TSL 1 (best)

Gene KTN1, Length 1,464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KTN1-222	ENST00000555506	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506		A8MZ25	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506		F8W810	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	P4HA2	O15460	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PGM3	O95394	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	LATS1	O95835	1130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PRKCG	P05129	697 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	MCM3	P25205	808 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	UBA7	P41226	1012 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	STK4	Q13043	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	RUNX2	Q13950	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	BECN1	Q14457	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	MIDN	Q504T8	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	DPF1	Q92782	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506		A0A1W2PQ09	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SCAMP1	O15126	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SEC14L5	O43304	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	BEST1	O76090	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	KRT10	P13645	584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	GCH1	P30793	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	FOXF2	Q12947	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	IRF3	Q14653	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	RNF183	Q96D59	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	CLTB	P09497	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PRR35	P0CG20	571 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	NR2F1	P10589	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	RRM1	P23921	792 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	NNMT	P40261	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	F2RL1	P55085	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	GHRHR	Q02643	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	GRIK3	Q13003	919 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	HSPB2	Q16082	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	EME1	Q96AY2	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	HSPB6	O14558	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTN1-222	ENST00000555506	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms